纯正堂药厂多年来十分重视自主创新工作，制定了产品研发项目、技术研发经费管理办法和研发人员绩效考核奖励等制度，有效调动了研发人员的积极性，并针对研发项目与广西工学院等高校开展了产学研活动，有效提升了企业科技研发水平及创新能力。每年都投入经费促进研发工作的开展，从90年代初期就率先研发出第一代清火类产品——清火栀麦片，该产品以清热解毒的明显疗效成为清火市场的领跑者;90年代中期该厂自主研发出第二代清火类产品——玉叶清火片，奠定了高端清火类产品的发言权;2009年历经十年研发出国家专利第三代清火类新药——玉叶金花清热片，是清火类药品重大技术突破，代表着目前清火类药的最高水平。该厂还被中国质量信用评价中心评为“2009年度AAA级中国质量信用企业”。
通过国家“高新技术企业”认定，企业将享受企业所得税由25%降为15%的税收优惠政策，同时享受企业研发投入抵扣成本最高按150%抵扣的优惠措施。
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